encodeURI zakóduje kompletní URL při zachování vyhrazených strukturálních znaků, zatímco encodeURIComponent zakóduje jednu komponentu a escapuje také tyto strukturální znaky.
Jak dokumentuje MDN Web Docs, encodeURI ponechává :, /, ?, #, &, a = nedotčené, takže celá adresa zůstává funkční, což je správné pro úplné URL adresy. encodeURIComponent escapuje vše kromě nevyhrazené sady RFC 3986, takže je správnou volbou pro hodnoty parametrů dotazu, segmenty cesty nebo text fragmentu, který může obsahovat vyhrazené znaky.
Použití encodeURI tam, kde je vyžadován encodeURIComponent, je častou chybou: nezakódovaný & uvnitř hodnoty bude chybně přečten jako oddělovač parametrů, čímž tiše dojde k poškození požadavku.